明朝年間，「開台先賢」顏思齊及鄭芝龍部隊先後在位於笨港溪（今北港溪）下游的 笨港登陸，建立了笨港十寨，展開漢人墾台的序幕。明天啟二年（西元1622年）來台 先民為求平安橫渡險惡黑水溝，至湄洲祖廟恭請聖尊奉祀船隻上，船隻途經笨港，媽 祖顯靈指示要永駐此地，保護台疆。十寨居民如獲至寶，輪流奉祀這尊全台最早的湄 洲媽祖。

至康熙三十九年（西元1700年）笨港居民鳩資合建「天妃廟」，隨清朝官方晉封媽祖 為天后，後又改稱「天后宮」。香火鼎盛，神譽遍及全台。詎料乾隆十五年（西元17 50年），濤濤的笨港溪氾濫，將笨港街中分為笨北港與笨南港。再加上乾隆四十七年 （西元1782年）漳泉械鬥，四年後的林爽文事件使笨南港受創，加上嘉慶年間的兩場 大水，天妃廟毀於洪水，笨南港居民因天災人禍東遷至麻園寮，建立新街市，謂「新 南港」：日治時期稱「新港庄」光復後改回「新港」之名，沿用至今。

當時，天妃廟住持景端法師將廟中諸神尊，文物隨移民遷移至麻園寮，暫祀肇慶堂土地公廟（今新港警察分駐所）。東遷後，時王得碌將軍經年在海上作戰，常化險為夷
，所戰皆捷，與日後飛黃騰達，深信皆為媽祖庇佑，為酬謝媽祖神恩，特捐俸且邀集十八庄人士共同捐貲重建天后宮。並於嘉慶十六年（西元1811年）新廟落成時，請旨敕封，御賜宮號「奉天宮」，這就是「新港奉天宮」的廟名由來。

相傳奉天宮建廟現址為風水絕佳的「白鶴穴」，建廟時十八庄居民，有錢出錢，有力出力，同心協力完工。十八庄信仰從建廟開始沿襲至今，新港奉天宮每屆董事會改選
上任後，頭年元宵節繞境活動除了例行性的新港街面繞境之外，還需擴大舉行繞境範圍涵蓋十八庄。

資料來源：新港奉天宮官方網站